| 1 | 猶太人相信耶穌字面上將三天重建聖殿 | 2:20 | 四福音合參 | |
| 2 | 尼哥底母認為耶穌是在談論文字上第二次出生 | 3:4,9 | 四福音合參 | |
| 3 | 撒瑪利亞婦人誤解耶穌所提到的“活水” | 4:10-15 | 四福音合參 | |
| 4 | 門徒未能把握耶穌提到他的“食物” | 4:31-34 | 四福音合參 | |
| 5 | 頑固的猶太人不接受耶穌作贖罪，不以耶穌作為“天上來的糧”，是他作為一個誰給他們自己的“肉”吃 | 6:32-35,52 | 四福音合參 | |
| 6 | 人們經常不了解有關耶穌在屬世以外的來歷和去處 | 6:42; 7:27,33-36; 8:21-22,27 |
四福音合參 1
四福音合參 2 |
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| 7 | 人們對於耶穌在伯利恆誕生感到困惑 | 7:41-42; cf.1:45-46; 7:52 |
四福音合參 | |
| 8 | 猶太人以為耶穌的所說關於亞伯拉罕的子孫是字面上的意思，而耶穌所指的是屬靈的後代 | 8:31-39 | 四福音合參 | |
| 9 | 猶太人不明白耶穌說那些順從他的人將永遠不會經歷死亡並且不明白耶穌說亞伯拉罕“仰望我的日子” | 8:51-53,56-58 | 四福音合參 | |
| 10 | 頑梗的法利賽人諷刺耶穌指出對他們的屬靈盲目 | 9:40-41 | 四福音合參 | |
| 11 | 法利賽人沒有掌握耶穌「我是好牧人」比喻的正確意義 | 10:6 | 四福音合參 | |
| 12 | 門徒誤解耶穌說拉撒路“睡了”，以為耶穌的聲明是字面上，誤以為耶穌使用“睡眠”作為死亡的比喻 | 11:11-13 | 四福音合參 | |
| 13 | 馬大以為耶穌是說拉撒路會在末日時復活，而耶穌卻表示他打算立刻使拉撒路復活 | 11:24 | 四福音合參 | |
| 14 | 人群歡呼耶穌可能作為以色列國的復國領袖，誤解耶穌的王權的真正本質 | 12:13 | 四福音合參 | |
| 15 | 門徒起先不明白耶穌凱旋進入耶路撒冷的意義．等到耶穌得了榮耀以後、纔想起這話是指着他寫的、並且眾人果然向他這樣行了。 | 12:16 | 四福音合參 | |
| 16 | 人群不明白耶穌所提及他“從地上被舉起來”是指他十字架代贖的恩典 | 12:32-34 | 四福音合參 | |
| 17 | 彼得不明白耶穌為他們洗腳的意義 | 13:6-11 | 四福音合參 | |
| 18 | 門徒在晚餐不明白猶大離席的關鍵性 | 13:28-29 | 四福音合參 | |
| 19 | 彼得誤解了耶穌指出彼得在當時無法跟耶穌去 | 13:36-38 | 四福音合參 | |
| 20 | 多馬跟着腓力誤解耶穌所提及他是“道路”，並他已將父神表明出來 | 14:5,8 | 四福音合參 | |
| 21 | 門徒不名白耶穌所指的“等不多時”是甚麼意思 | 16:17-18 | 四福音合參 | |
| 22 | 彼得將大祭司的僕人馬勒古的右耳砍掉顯示彼得仍然不明白耶穌要喝父所給他的那杯 | 18:11 | 四福音合參 | |
| 23 | 即使是在空墓，門徒仍然不明白從經文中預言耶穌必要從死裏復活 | 20:9 | 四福音合參 | |
| 24 | 抹大拉的馬利亞來到墳墓那裏遇到復活的耶穌還以為是以為耶穌是園丁 | 20:14-15 | 四福音合參 | |
| 25 | 門徒聚在一起去打魚遇見耶穌站在岸邊卻不知道他就是復活了的耶穌 | 21:4 | 四福音合參 |